قضايا تتعدّى الحدود الإقليمية

1. نزاعات دوليّة

أ. مع كازخستان: لم تصادق قيرغيزستان على معاهدة عام 2001، لترسيم الحدود مع كازاخستان.

ب. مع طاجيكستان: النزاعات في وادي إسفارا Isfara، تؤخر ترسيخ الحدود بين طاجيكستان وقيرغيزستان.

ج. أوزبكستان: ترسيم 130 كيلومتراً من الحدود مع أوزبكستان تعوقها خلافات خطيرة حول الجيوب والمناطق الأخرى.

2. اللاجئون والمشردون، طبقاً لتقديرات عام 2012.

أ. المشردون: 172 ألف شخص في يونيه 2010، جراء أعمال العنف جنوبي قيرغيزستان، بين الأغلبية القيرغيزية والأقلية الأوزبكية.

ب. من لا وطن لهم (عديمو الجنسية):  15473 شخصاً، ولد معظمهم في قيرغيزستان، وعاشوا فيها سنوات عدة، أو تربطهم علاقات زواج مع مواطنين قيرغيزيين. في عام 2009، تبنت قيرغيزستان خطة عمل وطني لتسريع عملية تبديل جوازات سفر القيرغيزيين الصادرة أثناء الحقبة السوفييتية. ويعاني عديمو الجنسية من مشاكل كثيرة، مثل: عدم قدرتهم على تسجيل عقودات الزواج أو شهادات الميلاد، أو السفر داخل البلاد وخارجها، وملكية الأراضي، وتلقي الإعانات الاجتماعية.

3. المخدرات

تُعدُّ قيرغيزستان، من الدول، التي يُزرع القنب والأفيون، في أراضيها. ويُستهلك جلُّه في كومنولث الدول المستقلة. تتبنى الحكومة، حالياً، برنامجاً محدوداً، للقضاء على زراعة المخدرات. وتستخدم البلاد، نقطةً لمرور المخدرات غير المشروعة، المتجهة من جنوبي غرب آسيا إلى كلٍّ من روسيا، وبقية دول أوروبا. كما تُعد مستهلكاً أساسياً للأفيون.